UniversitÓ degli Studi di Milano

Corso di laurea in Biotecnologie Industriali ed Ambientali a.a. 2013/14

Informatica Avanzata

Docente: Giorgio Valentini

DI, Dip. Informatica,  UniversitÓ degli Studi di Milano

e-mail: valentini@di.unimi.it


"Informatica Avanzata", e' un corso di programmazione in linguaggio R. Nel corso vengono fornite le nozioni di base del linguaggio e gli strumenti necessari per scrivere semplici script e programmi, sfruttando le ampie librerie open source disponibili.

In particolare, alla fine del corso gli studenti dovrebbero acquisire:
  • Conoscenze di base sul linguaggio e l'ambiente di programmazione R
  • CapacitÓ di scrivere semplici script e programmi in linguaggio R
  • CapacitÓ di utilizzare package R per sviluppare applicazioni software

Programma del corso:

  • Algoritmi e linguaggi di programmazione.
  • L'interfaccia grafica per l'utente di R
  • Identificatori e variabili; tipi di dati base; operatori, espressioni e istruzioni
  • Strutture dati fondamentali in R: vettori, fattori, matrici, array, liste, data frame ed environment
  • Strutture di controllo del flusso di esecuzione: blocchi, istruzioni condizionali, iterazioni
  • Funzioni e script
  • Operazioni di I/O
  • L'ambiente grafico di R
  • Package ed "estensioni" del linguaggio R
  • Bioconductor e package specifici per la bioinformatica
  • Programmazione object oriented in R.
Bibliografia:

Periodo di svolgimento, orari e sede del corso:

Periodo: Inizio: 3 marzo 2014. Termine corso: maggio 2014
Aula informatica Via Celoria 20, Milano
Lunedi ore 10.30-13.30
Giovedi ore 10.30-13.30

Slide del corso:


Soluzioni di alcuni esercizi:

Esame
Il progetto d'esame consiste nella realizzazione di un programma scritto in linguaggio R per la soluzione di un problema in ambito bioinformatico.
Testo del progetto d'esame:
Annotazione delle proteine del lievito con Support Vector Machine

Link utili: