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Descrizione e obiettivi del corso
Dopo il completamento del progetto Genoma per il sequenziamento del DNA umano, la genomica funzionale costituisce una delle principali linee di ricerca in biologia.La genomica funzionale studia le funzioni dei geni e le relazioni tra geni diversi nei processi biologici, i geni correlati a determinate malattie e le proteine ad essi associate, con rilevanti applicazioni sia
in campo medico, sia nell’ambito dell’industria farmaceutica e agro-chimica.
Le biotecnologie oggi utilizzate forniscono misure dei livelli di espressione genica di migliaia di geni simultaneamente. Quindi, al fine di estrarre conoscenza biologica dalla grande quantità di dati a
disposizione dei ricercatori, sono state sviluppate tecniche computazionali basate su metodi statistici e di apprendimento automatico.
Obiettivo di questo corso è l’introduzione ai principali problemi biologici inerenti la genomica funzionale, seguita da un’ampia panoramica sui metodi computazionali attualmente applicati per il
trattamento e l’analisi dei dati di espressione genica.
Una prima parte sarà dedicata a nozioni di base di genetica e biologia molecolare, necessarie per inquadrare le problematiche specifiche della genomica funzionale. Saranno inoltre illustrati gli aspetti fondamentali delle biotecnologie basate su DNA microarray.
Particolare rilievo verrà conferito alla forte interdipendenza fra genomica e bioinformatica, cioè fra la produzione dei dati di espressione genica, e le metodologie per l’analisi e l’interpretazione di tali dati. Saranno pertanto descritti i principali metodi bioinformatici per l’analisi dei dati di espressione genica, anche presentando loro applicazioni in ambito medico.
Prerequisiti
Il corso è di livello introduttivo, e si propone di fornire le conoscenza di base necessarie per la comprensione delle problematiche inerenti la genomica funzionale.Conoscenze matematiche di base (algebra lineare ed analisi al livello previsto per il II anno del corso di Fisica), ed elementari nozioni di probabilità e statistica sono comunque da ritenersi opportune. Le
nozioni di matematica necessarie per la comprensione dei metodi computazionali presi in esame, saranno comunque richiamate quando opportuno. Dal momento che non verrà richiesto agli studenti di scrivere
programmi in applicazione delle metodologie informatiche illustrate durante le lezioni, nozioni di programmazione e di informatica sono da considerarsi utili, ma non necessarie ai fini di superare l’esame.
Orario
Dal 16/2/2004 al 26/3/2004:Lunedi ore 11-13 aula A 602
Mercoledi ore 15-16 aula A 606
Dal 8/4/2004 al 28/5/2004:
Lunedi ore 11-13 aula A 602
Venerdi ore 11-13 aula A 602 o lab. informatica V piano